如果ETC扣费失败，可以按照以下步骤进行补缴：

在当时过完站的时候及时找人工通道的工作人员进行费用补扣，可以通过刷卡或缴纳现金的方式进行二次补扣。已经离开的收费站，可以在下次出收费站时一同扣除上次的款项。如果是在实行周期性扣费模式的地区使用ETC记账卡，那么可以在周期结束后及时补缴欠款。如果以上方法无法解决问题，可以到ETC服务中心进行故障检查，并补缴欠款。如果被系统判定为车辆逃费，需要将车辆加入ETC黑名单，并在高速收费站入口附近找工作人员处理。

需要注意的是，如果ETC扣费失败是由于信用卡逾期未还款或者信用卡超过有效期等自身问题导致的，需要先处理信用卡问题，然后再进行补缴。

具体操作可咨询银行或ETC服务中心的工作人员。