交通运输部对网友提出的将节假日高速公路免费时间延长至次日早晨6时的建议表示，将会深入研究论证并适时优化完善该政策。

交通运输部指出，现有的重大节假日小型客车免费通行政策旨在缓解节假日期间的公路收费站拥堵情况，方便公众出行。这一政策自实施以来，有效减少了收费站拥堵问题，提高了通行效率，同时也促进了旅游和汽车租赁等服务业的发展，得到了公众的广泛认可。

针对网友的建议，交通运输部表示，考虑到该政策已实施多年并取得实际效果，以及其涉及面广、情况复杂，对其进行改革调整需要科学评估和结合相关政策统筹考虑。因此，交通运输部计划会同相关部门，深入分析研究，结合相关法律修订，适时优化完善节假日小客车免费通行政策，以进一步提高收费公路服务水平，不断提升人民群众的获得感。

此外，这一建议的背后是公众对于优化交通政策、减少节假日返程压力的需求。节假日期间，尤其是最后一晚，由于车辆集中返程，加之抢免费时间节点，导致前半夜车流量较大，容易造成交通拥堵。延长免费时间至次日早晨6时，可能有助于分散返程车流，减轻节假日最后一天晚上的交通压力。

交通运输部的回应体现了政府对民众意见的重视，以及对现有政策进行调整和完善的开放态度。未来，随着政策的进一步优化，可以期待更加便利和高效的交通环境。