奥迪自动启停系统出现故障的可能原因有以下几点：首先，可能是由于驾驶员无意中关闭了系统开关，导致系统无法正常使用。此时，需要检查系统是否处于开启状态。其次，自动启停系统的正常运行需要满足一定的条件，如踩刹车、踩离合、拉手刹等常见操作，以及系好安全带、关闭车门等特殊要求。如果这些条件未得到满足，系统也可能无法正常工作。

此外，自动启停系统的工作原理是在车辆因拥堵或路口停车时，驾驶员踩下制动踏板并停车摘挡。此时，Start/Stop系统会自动检测一系列条件，包括发动机是否空转且无挡位、车轮转速是否为零以及电池是否有足够的能量进行下一次启动。只有当这些条件都满足时，发动机才会自动停止转动。当信号灯变绿后，驾驶员踩下离合器即可启动"启动停止器"，并迅速启动发动机。在自动挡车型上，一旦松开刹车或转动方向盘，发动机便会立即自动点火，驾驶员可以立即踩油门起步，整个过程都在D挡状态下进行。

请注意，以上内容仅为故障排查及工作原理的简要说明，具体故障原因可能因车型、使用状况等因素而异。如遇到自动启停系统故障，建议及时联系奥迪官方售后服务或专业维修站点进行检查和维修。