多年前，几乎每一款新车型都离不开柴油。宝马显然觉得MINI也不例外，因此在2003年6月推出了MINI One D，这是英国最著名的经济型汽车的首款柴油车型。这款1.4升涡轮增压柴油发动机（75马力）是由丰田公司生产的，该公司不久前刚刚在法产雅力士（Yaris）超小型轿车上使用了这款产品。新MINI采用全铝车身，紧凑的内部采用了共轨技术， 这能够让它更节油，能够每加仑多开5.88英里。
2004年春天，MINI敞篷车的推出也意味着全新篇章的开启。如果伊斯哥尼斯的灵魂对他最初的设计被重新诠释的方式表示不满的话，他可能会在这里找到一些安慰：尤其是尺寸，这款车的车顶是可电动开合的，折叠后可以放置在乘客座椅之 后，如此一来，行李舱空间就可以通过一个下拉式机构进入，这与1959年问世的第一辆Mini的下拉式车盖非常相似。就像伊斯哥尼斯最初的设计一样，相较于通过喷漆来掩饰廉价，他们聪明地选择使用镀铬，并用市场话术包装为“独有设计”。
敞篷软顶本身就是高品质织物，多层且隔热，并采用带有加热元件的玻璃后窗。当敞篷车顶放下时，后排乘客两侧的小窗会自动缩回。在敞篷车的整体设计 上，它实际上更像是一辆传统大众甲壳虫的敞篷版，且日常实用性比开篷后的优美线条更重要。敞篷车的规格共有3个选择，即One、Cooper或Cooper S。意大利时尚品牌Bisazza推出了一款敞篷车，车身覆盖着一件由3万颗宝石构成的“连衣裙”，此举可能是为了让该车更受女性的喜爱。这只是宝马MINI营销人员组织的众多吸引媒体眼球的活动之一，最终目的是能够触动汽车爱好者之外的潜在消费者， 向他们传达这款车的魅力。
在20世纪90年代末的落日余晖中，宝马公司从最初的那辆车开始推行个性化定制，推出了大量的选配件，因此几乎每一辆车都可以在生产线上为买家完成定制。通常意义上，喷涂样式、轮毂、装饰件和内饰等都是装饰物，而John Cooper Works高性能套件则在真正意义上提供了性能的提升。2005年，为Cooper S提供JCW动力增强套件成为出厂时已经备好的选项，其功率逐渐提高到210马力，而对于那些满足于标配但仅想要活跃气氛的用户来说，JCW音效套件提供 了一个更低沉的排气系统，而排气改装后只增加了3马力。
2006年推出了一款名为 MINI Cooper S John Cooper Works GP Kit的精装限量版，为了减轻车身重量，它没有后座，也没有空调，只有最少的隔音材料，还有一个碳纤维后扰流板。 这2000辆精装限量版都是由意大利的Bertone手工打造的，其中459辆被卖到了英国，如今这已经是一辆收藏级的经典车了。
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